Ten dział dla AFLOFARMU to niemalże misja firmy. O tym jak ważny jest to cel świadczyć może chociażby fakt jak wiele inwestujemy w tę dziedzinę. W roku 2007 na R&D przeznaczyliśmy ponad 14 mln zł. Nieustająco poszukujemy nowych rozwiązań, technologii i sposobów leczenia aby móc lepiej spełniać oczekiwania pacjentów, lekarzy i farmaceutów. ściśle współpracujemy z naukowcami i ekspertami z wielu dziedzin z całego kraju m.in. z: Uniwersytetu Medycznego w Łodzi, Akademii Medycznej w Warszawie i Gdańsku, Polskiej Akademii Nauk.